> по ctrl+j не выводит графики, то есть, я не могу инструментально увидеть тормоза
Используйте оранжевую вертикальную линию для теста равномерности.
SVP меню Утилиты > Тест плавности воспроизведения
> хотелось бы EVR починить
Рекомендую попробовать еще MPC Video Renderer
> могут ли тормоза быть связаны с использованием FreeSync?
Все возможно. Где-то на форуме находил перечень настроек в драйверах NVIDIA для того, чтобы снизить подергивания и повысить плавность. Настройка Vsync должна быть включена. По логике FreeSync - отключена. Начните с включения VSync.
> дополнительные тормоза (причем, стабильные раз в секунду) возникают, если в фоне запущен MSI Afterburner и RTSS
Утилиты полезны, если ими правильно пользоваться. Видать, В Вашем случае они либо подкручивают настройки видеокарты, либо необоснованно отнимают драгоценные ресурсы раз в секунду.